神经外科是一支以诊疗颅内肿瘤、脑血管病、颅内先天性疾病、脊髓疾病等为主的专业队伍，自成立以来，即努力打造成为国内传染病领域具有高水平、与感染性相关神经系统疾病的诊疗专科。科室配备了较高端手术设备：莱卡手术显微镜、蔡司神经内镜，超声刀，蛇牌开颅动力系统等。
治疗范围包括：
1、颅内肿瘤：脑膜瘤、胶质瘤、垂体瘤、颅咽管瘤、听神经瘤、淋巴瘤，尤其是颅底肿瘤及脑室内脑干肿瘤等。
2、颅内感染性疾病：隐球菌脑炎伴颅内压增高、脑脓肿、感染病灶的活检切除等。
3、颅内寄生虫病：脑囊虫病、脑弓形虫病等。
4、脑血管病：颅内动脉瘤、动静脉畸形、烟雾病、脑血管病的手术及介入手术等。
5、脑卒中的治疗：骨瓣开颅、微创钻孔引流、神经内镜血肿清除等.
6、脊柱脊髓疾病：脊髓神经鞘瘤、脊髓肿瘤、腰椎间盘突出等。
7、功能性神经疾病：三叉神经痛、面肌痉挛等神经病理性疼痛。
8、小儿神经系统疾病：先天性脑积水、脑肿瘤等。
9、颅脑及脊髓损伤等。
