传染病诊治领域位居国内前列。多次经历与霍乱、流脑、乙脑、麻疹、白喉、艾滋病、传染性非典型肺炎(SARS)、登革热、高致病性禽流感H7N9、甲型流感H1N1、寨卡病毒病、新型冠状病毒肺炎（COVID-19）等传染病的交锋。
如今已将现代化技术和先进理念贯穿于疾病诊断和救治，可以开展体外膜肺氧合(ECMO)、连续性肾脏替代治疗（CRRT）、血液净化等重症救治，肿瘤化疗，隐球菌脑膜炎综合治疗， HIV暴露阻断等治疗，开展纤维支气管镜检查、电子超声内镜的诊断和治疗、二代测序辅助检测病原，并和药学部、感染外科、妇产科、综合内科、眼科、耳鼻喉科、细菌室、病理科、放射科等科室开展多学科会诊，在艾滋病机会性感染和肿瘤诊治及抗病毒治疗全程管理、HIV母婴阻断、HIV暴露前后预防、不明原因发热与皮疹的诊治、突发传染病诊治、感染性疾病重症监测和精细化治疗等方面尤为突出，疑难重症传染病救治成功率在省内名列前茅，被评为广东医院最强科室。
